摘要： 研究旨在构建爱拔益加肉鸡（AA肉鸡）品种精确鉴定的特异性分子标记，用于AA 肉鸡品种分子鉴定。试验选取30只AA肉鸡，进行深度为15X的全基因组重测序，通过与已公 开的27个其他鸡品种336个个体全基因组重测序数据对比分析，在AA肉鸡组与非AA肉鸡组 之间进行选择性清除分析，构建机器学习模型并对其准确度进行验证。结果显示：全基因组 扫描共鉴定出98个差异SNPs，其中以碱基转换为主要变异类型，这些差异SNP位点主要分布于 第5和第20号染色体，利用逻辑回归学习算法构建模型后得到32个特异SNPs位点，主要位于 鸡Z染色体、第5号和20号染色体上。通过对AA肉鸡、哈伯德肉鸡、科宝肉鸡、固始鸡、淅川乌 骨鸡、卢氏绿壳蛋鸡、富凤麻鸡、贵妃鸡和海兰蛋鸡这9个品种KASP检测后输入模型进一步验 证，准确率为99.41%。研究基于重测序数据，成功开发并验证了可用于AA肉鸡品种精确鉴别 的 SNP标记，该方法对 AA肉鸡单一品种的鉴别准确率高达 99%以上，为 AA肉鸡品种的精准 鉴定提供可靠的技术手段。

关键词: 鸡；SNP；全基因组重测序；分子标记；KASP

中图分类号: 

• S831.2