摘要： 为了解湖北地方鸡的群体遗传结构和遗传多样性，从而更好地保护和利用湖北 省地方鸡遗传资源，研究基于全基因组重测序技术，对70只湖北地方鸡的全基因组单核苷酸多 态性进行分析。结果显示：通过观测杂合度、期望杂合度、近交系数、连锁不平衡衰减程度、核 苷酸多样性分析，发现五个湖北地方鸡品种具有较高的遗传多样性。主成分分析、Admixture 分析、系统进化树分析、基因流分析评估五个湖北地方鸡的群体遗传结构，发现湖北地方鸡因 地理分布相近，与其他地方鸡相比遗传背景也更相近；将其与红色原鸡进行两两比较，受选择 程度由大到小依次为郧阳大鸡、景阳鸡、江汉鸡、洪山鸡、双莲鸡。Treemix分析、f3检验评估湖 北地方鸡与来航鸡、洛克鸡的基因交流情况，发现双莲鸡与来航鸡间存在显著遗传交流；同 时，评估湖北地方鸡有效群体由大到小依次为江汉鸡、双莲鸡、景阳鸡、郧阳大鸡、洪山鸡。研 究表明，湖北地方鸡遗传多样性丰富，受外来品种基因渗入的影响，仅检测到双莲鸡与来航鸡 之间存在显著的基因交流，表明当前保种措施得当；与其他地方鸡相比，湖北地方鸡具有相似 的遗传背景，需要进一步加强保种措施，以确保湖北地方鸡遗传资源的可持续发展。
中图分类号:
