摘要： 研究旨在筛选东安鸡与商品肉鸡胚胎发育关键期腿肌差异表达的 miRNA，为深 入探究miRNA在东安鸡肌肉发育过程中的调控机制奠定基础。研究选取东安鸡、白羽肉鸡和 黄羽肉鸡胚胎期第 15天（E15）腿肌组织进行 HE染色和小 RNA测序。通过生物信息学分析， 对差异 miRNAs的靶基因进行功能富集分析，构建差异 miRNA-mRNA 调控网络，并随机选取 6个差异表达 miRNA 和 8个 mRNA 进行 qRT-PCR 验证。结果显示：9个测序文库中共鉴定出 824 个已知 miRNAs 和 81 个新的 miRNAs。东安鸡有 12 个 miRNA 与两种商品肉鸡都差异表 达，其中显著上调 3 个，显著下调 9 个。功能富集分析发现东安鸡差异 miRNA 的靶基因主要 富集在大分子代谢和细胞生长周期通路，包括糖酵解/糖异生代谢、花生四烯酸代谢、戊糖磷 酸途径、Wnt、P53 和 MAPK 信号通路。miRNA-mRNA 联合分析表明，gga-miR-194-TOR1B、 gga-miR-122-5p-WNT11B、gga-miR-200b-3p-MYO5A、gga-miR-135a-2-3p-PAX9 等互作对 可能是调控东安鸡肌肉发育及其相关性状形成的关键调控因子。QRT-PCR的检测结果与测 序结果、靶基因预测结果吻合，证实测序数据和分析结果准确可靠。研究表明，东安鸡与两种 商品肉鸡在E15腿肌中存在12个差异表达的miRNAs，这些miRNAs的功能聚焦在细胞大分子 代谢过程和生长发育信号通路，研究结果为深入探索东安鸡肌肉性状的分子调控机理和遗传 改良应用奠定基础。
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