中国家禽 ›› 2025, Vol. 47 ›› Issue (10): 16-22.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2025.10.003

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基于转录组测序筛选康乐黄鸡 开产相关基因和通路

马荆鄂,万淑敏,俞梓萱,许 桥,李袁飞,许继国*   

  1. (南昌师范学院生物技术研究院, 家禽遗传改良江西省重点实验室,江西南昌 330032)
  • 出版日期:2025-10-15 发布日期:2025-09-22
  • 作者简介:马荆鄂(1987-),女,博士,副教授,主要从事家禽遗传育种与繁殖研究,E-mail:382646281@qq.com

  • Online:2025-10-15 Published:2025-09-22

摘要: 为了筛选康乐黄鸡开产日龄相关候选基因,试验选取 154日龄已开产(H 组)、即 将开产(M 组)、未开产(L 组)各 3 个个体的下丘脑组织,利用 Illumina 测序平台进行转录组 测序,筛选组间差异表达基因,并对其进行功能注释和蛋白互作分析,随机选取 5 个基因,采 用实时荧光定量 PCR(RT-qPCR)验证其在 3 组个体下丘脑中的表达量。结果显示:在康乐 黄鸡下丘脑中,一共检测到 27 943 个基因表达;筛选出 1 104 个差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs);RT-qPCR 结果显示,POMC、GRP、PRL、SOUL、ALB 在 3 组个体中表达 趋势与测序结果相符;综合 GO、KEGG 和蛋白互作网络分析,初步确定 POMC、GRP、EPHA4、 EPHA5和EPHA6为与康乐黄鸡开产日龄相关基因,神经活性配体-受体相互作用(Neuroactive ligand-receptor interaction)为关键信号通路。研究表明,候选基因POMC、GRP、EPHA4、EPHA5 和 EPHA6及神经活性配体-受体相互作用信号通路可调控康乐黄鸡开产日龄性状。

关键词: 康乐黄鸡;转录组测序;下丘脑;候选基因;开产日龄性状

中图分类号: