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肉鸡屠宰性状全基因组关联分析
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王一东,陈智武,黄 超,粟永春,余 洋,崔焕先,郑麦青,赵桂苹,文 杰,王述柏
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2024, 46 (2):
1-6.
doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2024.02.001
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摘要
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多维度评价
为研究影响肉鸡屠宰性状选育的主要遗传因素,试验采用全基因组关联分析(Ge?
nome-wide association study,GWAS)挖掘与屠宰性状相关的单核苷酸多态性(Single nucleotide
polymorphism,SNP)位点和候选基因。以264只金陵花鸡终端父系公鸡为试验材料,采集血液
提取DNA,使用全基因组重测序技术获取个体基因型数据,使用PLINK 1.90软件对基因型数据
进行质量控制。对宰前体重、屠体重、半净膛重、全净膛重4个性状进行屠宰测定,使用EXCEL
和 R语言进行正态分布检验和相关性分析。使用 GEMMA软件进行 GWAS分析,定位出显著
的 SNP 位点。使用 SPSS 软件分析屠宰性状的有利基因型。结果显示:屠宰性状均符合正态
分布,相关度在0.96以上。定位到4个显著的SNP位点,注释到一个基因为RAB6A。1和 3号染色
体显著位点 TT 为有利基因型,19号染色体上显著位点 CC 为有利基因型。研究提示:应根据
挖掘到的显著SNPs和候选基因进行屠宰性状的选择,加强肉鸡屠宰性状分子育种的理论基础
以提高屠宰加工型肉鸡的选择进展。