摘要： 为系统解析标准蛋鸡品种与我国地方鸡品种的群体遗传差异，并从进化角度筛选与高产性状相关的候选基因，研究基于201份鸡基因组重测序数据（包括2个高产标准蛋鸡品种和9个中国地方鸡品种），整合单核苷酸多态性（SNP）和结构变异（SV）进行了群体遗传结构和选择信号分析。结果显示：高产蛋鸡标准品种（白来航鸡、洛岛红鸡）遗传背景更趋一致，而地方鸡品种则呈现出丰富的多样性及在中国由南向北的地理演化特征；选择信号分析，基因注释与功能富集显示，差异SV调控的基因，如ATP2B2（12：3934094-3934696del）、BMPR2（7：11465624-11465715del）富集于“蛋白质结构域特异性结合”功能，与钙信号传导和卵泡发育密切相关；而差异SNP所在基因则富集于神经发育与离子通道功能（如神经元投射、钾离子漏通道活性）。研究表明，高产标准蛋鸡品种与中国地方鸡品种在遗传结构上存在显著差异，并证实SV能有效识别传统SNP分析难以检测的基因，最终筛选出ATP2B2、IGF1R等11个与高产性状相关的潜在功能基因，为蛋鸡高产性状的遗传机制解析及分子育种提供了新视角和基因资源。

关键词: 蛋鸡；生产性状；选择信号；单核苷酸多态性；结构变异；候选基因

中图分类号: 

• S831.2