中国家禽 ›› 2026, Vol. 48 ›› Issue (10): 145-152.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2026.10.017
郭 通1,2,王海鸣2,3,姜琳琦1,2,王静静2,4*,刘华雷2*,黄雪伟1*
摘要: 研究旨在分析我国Ⅰ类(ClassⅠ)新城疫病毒(NDV)基因1.2亚型代表毒株的基因组遗传特性,揭示其分子特征和遗传进化关系。研究通过对3株Ⅰ类NDV进行基因组生物信息学分析,系统解析其基因组结构,分析F和HN蛋白功能区氨基酸变异、F基因同源性及进化动力学特征。结果显示:3株NDV分离株基因组全长均为15?198 nt,F蛋白裂解位点为112ERQERL117,符合弱毒株分子特征;F和HN蛋白在信号肽、七肽重复区和中和抗原表位等区域存在多处氨基酸变异;F基因同源性分析和遗传进化分析结果显示,3株NDV分离株F基因核苷酸相似性为96.2%~98.2%,均属于ClassⅠ基因1.2亚型;贝叶斯进化分析估算3株NDV分离株进化速率为8.32×10-4 ~1.58×10-3次替换/(位点·年),低于NDV强毒株进化速率〔1.70×10-3次替换/(位点·年)〕,但均处于RNA病毒正常进化速率范围内〔10-3~10-5次替换/(位点·年)〕。研究表明,3株基因1.2亚型NDV代表毒株均为弱毒株,其F和HN蛋白功能区存在多处氨基酸变异,病毒进化速率低于NDV强毒株,结果为我国家禽中流行的基因1.2亚型NDV基因组和生物学特性研究奠定基础。
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