摘要: 研究旨在挖掘与太行鸡 J 亚群禽白血病抗性或易感性相关的基因,以期为鸡禽 白血病抗病育种提供分子标记。试验采用 J 亚群禽白血病病毒(ALV-J)NX0101 株通过腹腔 注射途径接种 168 只1日龄未注射疫苗的太行鸡雏鸡,攻毒后第28天采集血液样本进行病毒 血症检测;对太行鸡血液 DNA进行全基因组重测序,并进行数据质控、比对和 SNP提取;以病 毒血症p27抗原水平为数量性状表型,利用GEMMA软件和混合线性模型进行全基因组关联分 析。结果显示,以p27抗原(S/P>0.2)为易感标准,鉴定出易感个体69只和抗性个体99只,经全 基因组关联分析(GWAS)筛选到达到全基因组和全染色体显著水平的位点分别为 7 个和 82 个,并注释 8 个和 43 个候选基因;GO 和 KEGG 富集分析显示,SOCS1L 和 PTDSS1 参与氨基 酸和脂质合成代谢途径,SEMA5A、THSD4、SH2D3C和ALCAM参与细胞黏附和维持细胞稳态等 途径;此外,还鉴定出与白血病感染密切相关的 5 个基因(CD169、PDZRN4、ITGA7、ITGA9 和 FBLN1),其中在 CD169基因中,g.91 277 471G>A达到显著水平。研究表明,CD169、PDZRN4、 ITGA7、ITGA9、FBLN1等可能是影响抗病性状的重要候选基因,为进一步细胞或个体水平的功 能验证奠定了基础,为鸡的禽白血病抗病育种提供参考。
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