摘要: 为挖掘J亚群禽白血病病毒(ALV-J)感染诱导肿瘤形成所调控的宿主基因,试验 对正常鸡和 ALV-J感染致瘤鸡的肝脏进行采样,对样本 RNA进行全转录组测序,筛选差异表 达的基因并进行 GO 功能分析和 KEGG 通路富集分析。结果显示:差异表达的 mRNA 共有 1 896个,其中1 687个上调,209个下调;差异表达的lncRNA共有339个,其中295个上调,44个 下调;差异表达的 circRNA 共有 43 个,其中 29 个上调,14 个下调。差异表达的 mRNA 中, SFRP1基因显著关联于Wnt信号通路相关的三个GO生物学过程;MYH9基因显著富集于相同 蛋白结合条目和多个与肿瘤发展相关的 GO 功能条目;CCND3 基因、MYC 基因显著富集于细 胞周期通路等与肿瘤发生发展密切相关的多个通路;lncRNA 靶基因 JARID2 在差异表达的 lncRNA 靶基因的 GO 功能富集分析中显示出最广泛的关联性;差异表达 circRNA 的来源基因 LDHA显著富集于糖酵解/糖异生和丙酸代谢通路,HK2则特异性富集于糖酵解/糖异生和碳素 代谢通路。结果表明,CCND3、MYC、MYH9、SFRP1可能是ALV-J感染诱导肿瘤形成的关键基 因,部分 lncRNA 可能通过调控 JARID2、部分 circRNA 可能通过调控 HK2、LDHA等基因的表达 参与ALV-J感染诱导肿瘤形成的过程。
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