中国家禽 ›› 2025, Vol. 47 ›› Issue (10): 148-154.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2025.10.019

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肉种鸭抗沙门氏菌感染受选择基因分析

朱春红1,刘宏祥1,王志成1,顾昊天1,陶志云1,曾 涛2,宋卫涛1,徐文娟1,章双杰1,古丽娜·艾山3,王逸飞1,李慧芳1*   

  1. (1.江苏省家禽科学研究所,江苏扬州 225125; 2.浙江省农业科学院,浙江杭州 310009; 3.伊犁哈萨克自治州畜牧总站(伊犁哈萨克自治州畜牧科学研究所),新疆伊犁 835000)
  • 出版日期:2025-10-15 发布日期:2025-09-22
  • 作者简介:朱春红(1982-),女,博士,研究员,主要从事家禽遗传资源评价与保护研究,E-mail:zhuch_1304428@126.com

  • Online:2025-10-15 Published:2025-09-22

摘要: 为探讨鸭抗沙门氏菌感染可能机制,试验使用选择信号分析方法鉴定与抗沙门 氏菌感染相关的候选基因,为肉鸭抗病育种提供参考。试验选择肉种鸭群体中沙门氏菌抗体 高低差异的肉种鸭 80 只(沙门氏菌抗体高低组各 40 只)个体,采集翅静脉血,利用 T7 基因测 序仪进行10×深度测序,采用XP-EHH方法对获得的高质量SNPs位点鉴定基因组显著差异区 域,挖掘全基因组范围内潜在的抗沙门氏菌感染相关基因。结果显示:对SNPs位点质控后共 获得 445 530个SNPs,XP-EHH方法筛选到288个受选择基因;GO富集分析发现基因ANAPC5、 CDK1、MYO6、DCTN1、PPP2R2D、HSPA2、SCX、TWF2、DCUN1D1、PTPRS、HIF1A、PTPRS、 HAGHL被富集到生物学过程、细胞组分或分子功能前 10条通路中;KEGG 富集通路中与细菌 感染或者免疫系统相关的通路主要有沙门氏菌感染、c型凝集素受体信号通路、RIG-I样受体 信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路,涉及的基因有AKT3、PIK3C2B、ITPR3、 MYO6、DCTN1、CALML4、AZI2。综上所述,在肉种鸭中筛选到可能与鸭抗沙门氏菌抗性相关基 因20个,初步从全基因组学角度揭示肉种鸭抗沙门氏菌感染遗传机制,为后续肉鸭抗病育种 奠定了基础。

关键词: 肉种鸭;抗沙门氏菌感染;全基因组;受选择基因

中图分类号: