中国家禽 ›› 2024, Vol. 46 ›› Issue (9): 34-45.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2024.09.005

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马岗鹅早期发育阶段腿肌lncRNA-miRNA-mRNA网络构建与分析

洪龙胜1,2,许丹宁1,李婉雁1,曹 楠1,付新亮1,田允波1,李玉谷2*,李冰心1*   

  1. (1.仲恺农业工程学院动物科技学院,广东广州 510225; 2.华南农业大学兽医学院,广东广州 510642)
  • 出版日期:2024-09-15 发布日期:2024-09-19
  • 作者简介:洪龙胜(1999-),男,硕士研究生,研究方向为水禽发育,E-mail:hls_6992@163.com

  • Online:2024-09-15 Published:2024-09-19

摘要: 为探究非编码 RNA 对鹅骨骼肌生长发育的调控机制,试验以 20 胚龄和孵化后 3日龄马岗鹅的腿部肌肉作为研究对象,通过 HE染色观察不同阶段腿肌组织结构差异,并通 过RNA测序探讨可能影响腿肌生长发育的RNAs。3日龄马岗鹅腿肌相较于20胚龄显示出了完 整的肌纤维结构,肌纤维轮廓清晰;两阶段内共有 2 289 个差异表达 mRNAs,17 个差异表达 miRNAs 和 192 个差异表达 lncRNAs;差异表达基因在骨骼肌生长和发育相关的通路中显著 富集,如细胞周期、FoxO信号通路和MAPK通路等;研究通过预测差异表达的mRNA和lncRNA 与 miRNA 的靶向关系,成功构建一个与骨骼肌生长发育密切相关的 ceRNA 网络,其中 36 个 lncRNAs、10 个 miRNAs 被预测可以调控 CCNB2、SHC4、ANGPT2、NRK、SLC25A4、WHAMM、 FREM1、HMMR、PHKG1、DUSP1 和 COL1A2 等与腿肌生长发育相关的基因。研究结果揭示了 lncRNA和miRNA在鹅腿肌生长和发育中的潜在功能和机制,为进一步的研究提供了参考。

关键词: 马岗鹅;全转录组分析;ceRNA;腿肌

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