摘要: 为研究 circRNA 和 miRNA 对鸡胚胎骨骼肌发育的调控作用,试验随机选取已孵 化 10 d(E10)、14 d(E14)和 18 d(E18)的藏鸡胚胎各 3个,采集胚胎腿肌组织进行组织形态学 观察和转录组测序,筛选差异表达的 circRNA、miRNA 和 mRNA,对差异表达基因进行 GO 和 KEGG 富集分析,并预测可以靶向同一 miRNA 的 circRNA 和 mRNA,筛选与肌肉发育相关的 mRNA 构建 circRNA-miRNA-mRNA 调控网络,采用实时荧光定量 PCR(RT-qPCR)对测序结 果进行验证。结果显示:E10期到 E18期是肌纤维形成期,也是决定肌纤维数量的关键阶段; 共有59个circRNAs、143个miRNAs和745个mRNAs在三个时期差异表达,差异表达的mRNA 显著富集在肌肉结构发育、肌纤维发育、肌小管细胞发育、ECM 受体相互作用通路、黏着斑信 号通路和 PI3K-Akt 信号通路等 GO 条目和信号通路上;从中筛选与骨骼肌发育相关的 88个 mRNAs构建了骨骼肌发育相关的circRNA-miRNA-mRNA调控网络,包括42个circRNAs、50个 miRNAs和47个mRNAs,一起构成了305个circRNA-miRNA-mRNA 相互作用对;RT-qPCR 结 果与转录组测序结果一致,证实了转录组测序的可靠性。研究结果揭示了circRNA、miRNA和 mRNA在鸡胚胎骨骼肌发育过程中的潜在功能和机制,为进一步的研究提供了理论依据。
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