中国家禽 ›› 2024, Vol. 46 ›› Issue (4): 8-14.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2024.04.002

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娄门鸭胸肌性状相关指标的全基因组关联分析

刘宏祥1,沈永杰2,张丽华2,周腾彬2,刘小倩2,章双杰1,朱春红1,朱 静2,陈晓颖2,黄学成2,宋卫涛1,陶志云1,王志成1,徐文娟1,李慧芳1*   

  1. (1.江苏省家禽科学研究所,江苏扬州 225125; 2.昆山市畜牧兽医站,江苏苏州 215300)
  • 出版日期:2024-04-15 发布日期:2024-04-18
  • 作者简介:刘宏祥(1985-),男,硕士,副研究员,主要从事家禽遗传资源评价与利用研究,E-mail:lhxatyz@foxmail.com

  • Online:2024-04-15 Published:2024-04-18

摘要: 为寻找与鸭胸肌性状相关的候选基因,鉴定鸭胸肌性状相关分子标记,试验以 199 只娄门鸭为试验材料,采集血液提取 DNA,用基因组重测序方法进行基因分型,利用 PLINK 1.90对分型结果进行质控后,采用rMVP软件中的FarmCPU模型对SNPs(Single nucleo? tide polymorphisims)与胸宽、胸深、胸肌重和胸肌率4个性状指标做GWAS分析,定位出显著位 点。结果显示:与胸宽相关的 SNPs 位点有 4 个,位于 1、11、18 号染色体上;与胸肌重相关的 SNPs位点有2个,位于2、3号染色体上;与胸肌率相关的SNPs位点有2个,位于2号染色体上。 通过基因功能注释,这些位点对应的胸肌性状候选基因有 8 个,分别是 LOC119715526、 RLBP1、ABHD2、KYAT1、SPOUT1、LOC101800569、EVA1A和NOL4。研究表明,在不同染色体上 共鉴定到8个与胸肌性状显著相关的SNPs位点,这些位点共涉及8个候选基因。

关键词: 鸭;胸肌;全基因组关联分析;单核苷酸多态性

中图分类号: