中国家禽 ›› 2022, Vol. 44 ›› Issue (8): 16-20.doi: 10.16372/j.issn.1004-6364.2022.08.003

• 遗传育种 • 上一篇    

白耳黄鸡冠齿数性状全基因组关联分析

张文武1,邱峰芳1,刘 影1,许继国2*   

  1. (1.东华理工大学化学生物与材料科学学院,江西南昌 330013; 2.南昌师范学院生物技术研究所,江西地方鸡种遗传改良重点实验室,江西南昌 330029)
  • 发布日期:2022-08-19
  • 作者简介:张文武(1985-),男,博士,讲师,主要从事鸡遗传育种与繁殖研究,E-mail:125714992@qq.com

  • Published:2022-08-19

摘要: 试验采用全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)寻找与白耳黄鸡冠齿数性状相关的候选基因。以82只白耳黄鸡为试验材料,采集血液提取DNA,然后用Illumina鸡60 K芯片进行基因型分型,利用PLINK 1.90对分型结果进行质控后,采用GEMMA软件对SNPs(Single nucleotide polymorphisins)与性状做GWAS分析,定位出显著位点。结果显示:与冠齿数相关的SNP位点有7个,位于白耳黄鸡1、2、4号染色体上。通过基因功能注释,预测WNT9A基因可作为白耳黄鸡冠齿数的重要候选基因。研究结果将为白耳黄鸡冠齿数的选择提供候选分子标记,为地方鸡标记辅助选择提供新的思路。

关键词: 全基因组关联分析;白耳黄鸡;单核苷酸多态性;冠齿数

中图分类号: